Das Unterrichtsfach Sport wird von der 5. bis zur 10. Klasse zwei- bzw. dreistündig im Klassenverband unterrichtet. Im 7. Jahrgang wird das Unterrichtsfach dreistündig unterrichtet.

Basketball und Badminton bilden die Schwerpunktsportarten. Judo wird in Klasse 5 unterrichtet.

Die große Außensportanlage bietet der Wilhelmine Fliedner Schule Hilden vielfältige Möglichkeiten, Schulsport außerhalb der Sporthalle stattfinden zu lassen. Der Schulhof wird für den Unterricht im Bewegungsfeld Gleiten, Fahren, Rollen zum Skaten, Wave- und Longboarden genutzt.

Neben einer Judo AG wird in Zusammenarbeit mit dem Hildener Basketball-Verein TUS96 Hilden eine Basketball AG angeboten. Dadurch sind während der AG-Zeit zusätzlich Vereinstrainer und -spieler in der Halle anwesend und trainieren zusammen mit unseren Schülern. Das Konzept, damit unsere Schüler mit Verein, Trainern und Spielern vertraut zu machen, hat sich bislang gut bewährt. Durch Basketball-Schnupperstunden, die der Jugendkoordinator des Vereins im Rahmen des Sportunterrichts der 5. und 6.Klassen leitet, werden weitere Schüler für den Basketball-Sport gewonnen.

Regelmäßig nimmt die Wilhelmine Fliedner Schule Hilden an Stadt- und Kreismeisterschaften teil.